《來吧！營業中》在播出後受到觀眾的熱烈迴響，但意外傳出播出的電視台TVBS與製作公司好看娛樂因合作理念出現分歧，導致雙方決定各自採取不同的道路。電視台計劃重新找藝人製作《來吧！營業中2》，而好看娛樂則將帶著原班人馬推出全新節目。對此，好看娛樂和TVBS皆已回應相關報導。
根據《聯合報》報導，雙方在如何運用節目IP上存在不同觀念，因此決定分道揚鑣。好看娛樂證實他們確實有一個新節目正在規劃中，並將在近期開始錄影。然而，合約本身就是按季度簽訂的，並沒有預先簽下第二季的合作協議，因此並不存在所謂的「拆夥」問題。至於外界有關庹宗康、姚元浩、炎亞綸、鬼鬼等人是否集體離開的傳言，雙方對此並未多作回應。
TVBS回應表示：「感謝過去製作團隊在這段期間的努力付出，共同創造出亮眼的成績，期待未來各自再創佳績。」並表示第一季的《來吧！營業中》在收視率和多平臺擴散效益方面取得了相當亮眼的成果，對第二季抱有很大期望。「在內容和卡司方面，我們將從更創新和多元的企劃角度出發。同時，基於節目的成功，我們將整合來自網友觀眾和各方的回饋意見，為第二季注入更有趣、更貼近實境的內容角度。除了延攬優秀的製作人、導演和製作團隊，還將加入更強大的卡司陣容。第二季的播出將擴大與各個平臺的合作，期待帶給觀眾全新且耳目一新的內容。」
這次《來吧！營業中》製作方面的分歧對於該節目所屬的電視台和製作公司都帶來了相當大的影響，投資者和觀眾們也需要密切關注接下來的發展情況。同時，這也提醒著電視台和製作公司在合作過程中更加注重共識和溝通，以確保節目的順利進行並維護觀眾的利益。